Perlのバージョン は何ですか？またそのパスは何ですか？

PERL　version 5.8です。
パスはともに　#!usr/bin/perl　です。
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Shellスクリプト, Perl,PYTHOLONなどです。

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CGIに関しては、Yahoo JapanからリンクされているCGI関連のページが参考になるかと思います。...

CGIファイルを転送する先のディレクトリ名はcgi-bin ですか？

cgi-bin も利用可能ですがpublic_html内でしたらどこでも動作可能です。